Lähes kaikki orgaaniset yhdisteet sisältävät myös hiili-vety- tai C-H-sidoksia. Ota huomioon, että hiiltä sisältävä ei riitä jotta yhdistettä voidaan pitää orgaanisena. Etsi sekä hiiltä että vetyä.
Eläviin organismeihin liittyvät molekyylit ovat orgaanisia. Näitä ovat nukleiinihapot, rasvat, sokerit, proteiinit, entsyymit ja hiilivetypolttoaineet. Kaikki orgaaniset molekyylit sisältävät hiiltä, melkein kaikki vetyä ja monet myös happea.
Epäorgaanisiin aineisiin kuuluvat suolat, metallit, yksittäisistä elementeistä valmistetut aineet ja muut yhdisteet, jotka eivät sisällä vetyyn sitoutunutta hiiltä. Jotkut epäorgaaniset molekyylit sisältävät itse asiassa hiiltä.
Vaikka suurin osa kemiassa esiintyvistä orgaanisista yhdisteistä tuottaa eläviä organismeja, molekyylien on mahdollista muodostua muiden prosessien kautta.
Esimerkiksi, kun tutkijat puhuvat Plutosta löydetyistä orgaanisista molekyyleistä, tämä ei tarkoita, että maailmassa on muukalaisia. Auringonsäteily voi tarjota energiaa orgaanisten yhdisteiden tuottamiseksi epäorgaanisista hiiliyhdisteistä.