Monet yhdisteet puhdistetaan kiteyttämällä vesiliuoksesta. Kide sulkee pois monia epäpuhtauksia, mutta vesi mahtuu kiteiseen hilaan, ilman että se olisi kemiallisesti sitoutunut yhdisteen kationiin. Lämmön käyttäminen voi poistaa tämän veden, mutta menetelmä vahingoittaa yleensä kiteistä rakennetta. Tämä on hienoa, jos tavoitteena on saada puhdas yhdiste. Se voi olla epätoivottavaa kasvatettaessa kiteitä kristallografiaan tai muihin tarkoituksiin.
Joskus nämä kaksi muotoa yhdistetään. Esimerkiksi [Cu (H2O)4]NIIN4· H2O: ta voidaan käyttää kuvaamaan kupari (II) sulfaatin kiteytymisvettä.
Vesi on pieni, polaarinen molekyyli, joka on helposti sisällytetty kidehilaan, mutta se ei ole ainoa kiteistä löytyvä liuotin. Itse asiassa suurin osa liuottimista jää suuressa tai pienemmässä määrin kiteeseen. Yleinen esimerkki on bentseeni. Liuottimen vaikutuksen minimoimiseksi kemistit yrittävät tyypillisesti poistaa niin paljon kuin mahdollista tyhjöuutolla ja voivat lämmittää näytteen jäljellä olevan liuottimen poistamiseksi. Röntgenkristallografia voi usein havaita liuottimen kristallissa.