William Goldingin romaani 1954 kärpästen herra kertoo nuorten poikien ryhmän, joka on yksin autioisella saarella. He kehittävät säännöt ja organisaatiojärjestelmän, mutta ilman aikuisia toimimaan ”sivistyvänä” impulssina, lapsista tulee lopulta väkivaltaisia ja raakoja. Romaanin yhteydessä tarina poikien kaaosta laskeutumisesta viittaa siihen, että ihmisen luonto on pohjimmiltaan villi.
Luvut 1-3
Romaani avataan nuoren pojan, nimeltä Ralph, ja pullean, lasillisen pojan kanssa, kun he kävelevät laguunille yllään koulupukuissaan. Pian saamme tietää, että he ovat osa sodan aikana evakuoitujen poikien ryhmää, jotka selvisivät sellaisesta lentokoneonnettomuudesta, jonka jälkeen heidän epäiltiin olevan vihollisen hyökkäys. Koska Ralph ja toinen poika, jonka ympärillä ei ole aikuisia, päättävät, että heidän on kiinnitettävä muiden selviytyneiden lasten huomio. Ralph etsii kotilo-kuoren ja alkaa puhaltaa siihen kutsumalla kohinalla toiset pojat. Pullea poika paljastaa, että muut lapset kutsuivat häntä sikaksi.
Ralph uskoo pelastuksen olevan välitöntä, mutta Piggy väittää, että heidän on järjestettävä järjestäytymisensä vuoksi, koska he voivat olla luukussa jonkin aikaa. Muut pojat valitsevat Ralphin johtajakseen, vaikka valinta ei olekaan yksimielinen; kuoropoikat, johtajana Jack Merridew, eivät äänestä Ralphin puolesta. Ralph antaa heille luvan metsästysryhmän perustamiseen. Ralph perustaa nopeasti karkean hallinto- ja järjestysmuodon, kehottaen poikia nauttimaan vapaudesta, työskennellä yhdessä molemminpuolisen selviytymisen puolesta ja ylläpitää savusignaalia rannalla houkutellakseen potentiaalia pelastajat. Pojat puolestaan ovat yhtä mieltä siitä, että jokainen simpukka pitää puhua keskeytyksettä.
Ralph, Jack ja poika nimeltä Simon ovat suosittuja johtajia ja alkavat kireän kumppanuuden. He tutkivat saarta ja vahvistavat sen olevan autio, mutta etsii hedelmäpuita ja luonnonvaraisten sikojen lauman, jonka Jack päättää, että hän ja hänen ystävänsä metsästävät. Pojat käyttävät Piggy's laseja sytyttämään tulipalon, mutta Piggy löytää itsensä nopeasti syrjäytyneeksi ystävyydestään Ralphin kanssa. Simon alkaa valvoa nuorempien poikien huolenaiheita, joihin viitataan nimellä "lyöntejä".
Luvut 4-7
Alkuperäinen organisaation puhkeaminen ei kuitenkaan kestä kauan. Ilman aikuisia suurin osa pojista kieltäytyy tekemästä minkäänlaista työtä ja viettää sen sijaan leikkimään ja nukkumaan. Yöllä huhut hirvittävästä hirviöstä puissa herättävät paniikin. Ralph väittää, että hirviöitä ei ole, mutta Jack sanoo toisin. Hän väittää, että metsästäjät löytävät ja tappavat hirviön, mikä lisää hänen suosionsa.
Jack kokoaa joukon poikia metsästysmatkailuun, joka vie heidät pois signaalipalon ylläpitämisestä. Tuli sammuu. Pian sen jälkeen vene kulkee saaren ohi, mutta ei huomaa poikia tulipalon puutteen vuoksi. Kun Jack ja muut metsästäjät palaavat voittoon sian kanssa, Ralph kohtaa Jackin valittaen menettäneensä mahdollisuutensa pelastuakseen. Jack, vihainen siitä hetkestä, kun hänet pilaantuu, tietää, että ei voi taistella Ralphia vastaan, ja lyö näin Piggyä ja rikkoa hänen lasinsa.
Kun pojat kokkivat ja syövät sikaa raivoisasti - jättäen huomiotta heikosti kypsennetyn sianlihan syömisen - Ralph kertoo Piggylle haluavansa lopettaa johtajuuden, mutta Piggy vakuuttaa hänet pysymään jatkossa. Possu on kauhistunut siitä, mitä voi tapahtua, jos Jack ottaa kokonaan haltuunsa.
Eräänä iltana saaren lähellä olevien lentokoneiden välillä käydään taistelutaistelua, ja hävittäjälentäjä karkaa. Tapettu ilmassa, hänen ruumiinsa kelluu alas saarelle ja takertuu puihin. Poika näkee ruumiinsa ja laskuvarjoaan ja on kauhuissaan vakuuttunut nähneensä hirviön. Jack, Ralph ja Roger-niminen poika lähtevät metsästämään hirviötä, ja kaikki kolme poikaa näkevät ruumiin ja ajavat kauhua.
Luvut 8–12
Nyt vakuuttuneena hirviön todellisuudesta, Ralph kutsuu koolle kokouksen. Jack yrittää vallankaappausta, mutta pojat kieltäytyvät äänestämästä Ralphia alaspäin, ja Jack lähtee vihaisena sanomalla, että hän perustaa oman heimonsa. Roger hiipii pois seuraansa. Yhä useammat pojat alkavat hiipiä liittyäkseen Jackin heimoon houkuttelemalla paistettua sikaa, jonka Jack ja hänen metsästäjät pystyvät tarjoamaan. Jack ja hänen seuraajansa alkavat maalata kasvonsa ja käyttäytyvät yhä metsäisemmällä ja alkeellisemmalla tavalla, kun taas Ralph, Piggy ja Simon yrittävät ylläpitää samanlaista järjestystä turvakoteilla.
Simon, joka kärsii joskus henkisistä iskuista, menee metsään usein ollakseen yksin. Piiloutuneena hän havaitsee Jackin ja hänen heimon suorittavan rituaalin, jonka tarkoituksena on tyydyttää hirviö - he iskevät sian pään teroitettuun sauvaan ja jättävät sen uhraukseksi. Siihen tulee nopeasti kärpäsiä, ja Simon hallusinoi sen kanssa vuoropuhelun viitaten siihen kärpäsien herraksi. Sian pää sanoo Simonille olevan typerää kuvitella hirviö olevan lihaa ja verta sisältävä asia; itse pojat ovat hirviö. Perhojen herra kertoo sitten Simonille, että muut pojat tappavat hänet, koska hän on ihmisen sielu.
Kun Simon kävelee, hän kohtaa kuolleen lentäjän ja tajuaa löytäneensä todisteet siitä, että hirviötä ei ole olemassa. Hän palaa takaisin muiden poikien luo, jotka ovat alkaneet tanssia hullun rituaalin parissa. Kun Simon alkaa murtautua puiden läpi, pojat uskovat hän on hirviö, ja kaikki pojat - mukaan lukien Ralph ja Piggy - hyökkäävät häneen kauhussa tappaen hänet.
Sillä välin, Jack on tajunnut, että vaikka kotilo on voiman symboli, todellinen voima on Piggy's lasissa, joka on ryhmän ainoa keino tulipalon aloittamiseen. Jackillä on useimpien poikien tuki, joten hän suorittaa ratsian Ralphille ja hänen jäljelle jääville liittolaisilleen varastaakseen Piggy-lasit. Ralph menee heidän kotiinsa saaren toisella puolella, kivimuodostelmaan, joka tunnetaan nimellä Castle Rock. Hän ottaa kotilo ja mukana on Possu ja vain kaksi muuta poikaa, kaksoset nimeltään Sam ja Eric. Hän vaatii Jackia palauttamaan lasit. Jackin heimo yhdistää Samin ja Ericin, ja Ralph ja Jack käyvät taistelua. Hälyttynyt possu ottaa kotonan ja yrittää osoittaa pojille pyydettäessä järjestystä. Roger hiipii possujen yläpuolella ja pudottaa hänelle raskaan kivin, tappaa pojan ja tuhoaa kotilo. Ralph pakenee jättäen Samin ja Ericin taakse. Jack satuttaa kaksoset, kunnes he suostuvat liittymään hänen heimoonsa.
Jack käskee metsästäjiä lähtemään Ralphin jälkeen, jolle Sam ja Eric ovat kertoneet aikovansa tappaa hänet ja lyödä päätään sauvalle. Ralph pakenee metsään, mutta Jack sytyttää puita ajaakseen hänet ulos. Kun liekit alkavat kuluttaa koko saarta, Ralph juoksee epätoivoisesti. Rantaa lyömällä Ralph kompastuu ja putoaa vain löytääkseen itsensä brittiläisen merivoimien jalkaan. Laiva huomasi liekit ja tuli tutkimaan.
Kaikki lapset, Ralph ja Jack mukaan lukien, alkavat yhtäkkiä itkeä, romahtaen uupuneeksi. Upseeri on järkyttynyt ja ilmaisee pettymyksensä siitä, että hyvät brittiläiset pojat joutuvat tällaiseen väärinkäytön ja rajuuden tilaan. Sitten hän kääntyy ja opiskelee omaa sotalaivaaan mietiskellen.