Mesenkefalonissa sijaitsee useita rakenteita, mukaan lukien tectum, tegmentum, aivokalvo, justi nigra, crus cerebri ja aivohermot (okulomotorinen ja trochlearinen). Tectum koostuu pyöristetyistä kohoumista, joita kutsutaan colliculiksi ja jotka ovat mukana näkö- ja kuuloprosesseissa. aivokalvo on kimppu hermokuituja, jotka yhdistävät etu- ja taka-aivot. Aivokalvo sisältää tegementum (muodostaa keskiaivon perustan) ja murskaväli (hermorakeet, jotka yhdistävät isot aivot kanssa pikkuaivot). rodia nigra on hermoyhteydet etusuorat ja muut aivojen alueet, jotka osallistuvat motoriseen toimintaan. Essu nigran solut tuottavat myös dopamiinia, kemiallista lähettiä, joka auttaa koordinoimaan toimintaansa lihas liikettä.
Neurodegeneraatio hermosolut päätelmässä nigra johtaa dopamiinituotannon pudotukseen. Merkittävä dopamiinitasojen menetys (60-80%) voi johtaa Parkinsonin taudin kehittymiseen. Parkinsonin tauti on a hermosto häiriö, joka johtaa moottorin ohjauksen ja koordinaation menetykseen. Oireita ovat vapina, liikkeen hitaus, lihasjäykkyys ja tasapainohäiriöt.