Aminohapot ovat orgaanisen hapon tyyppi, joka sisältää sekä karboksyyliryhmän (COOH) että aminoryhmän (NH2). Aminohapon yleinen kaava on annettu alla. Vaikka neutraalisti varautunut rakenne on yleensä kirjoitettu, se on epätarkka, koska hapan COOH ja emäksinen NH2 ryhmät reagoivat keskenään muodostaen sisäisen suolan, jota kutsutaan kahtaisioniksi. Zwitterionilla ei ole nettovarausta; on yksi negatiivinen (COO-) ja yksi positiivinen (NH3+) veloittaa.
On 20 aminohappoa johdettu proteiineja. Vaikka luokittelemiseen on useita menetelmiä, yksi yleisimmistä on ryhmitellä ne sivuketjujensa luonteen mukaan.
Niitä on kahdeksan aminohappoja ei-polaarisilla sivuketjuilla. Glysiinillä, alaniinilla ja proliinilla on pieniä, polaarittomia sivuketjuja ja ne ovat kaikki heikosti hydrofobisia. Fenyylialaniinilla, valiinilla, leusiinilla, isoleusiinilla ja metioniinilla on suurempia sivuketjuja ja ne ovat voimakkaammin hydrofobisia.
Siellä on myös kahdeksan aminohappoa, joissa on polaariset, varaamattomat sivuketjut. Seriinillä ja treoniinilla on hydroksyyliryhmiä. Asparagiinilla ja glutamiinilla on amidiryhmiä. Histidiinillä ja tryptofaanilla on heterosykliset aromaattiset amiinisivuketjut. Kysteiinissä on sulfhydryyliryhmä. Tyrosiinilla on fenolinen sivuketju. Kysteiinin sulfhydryyliryhmä, tyrosiinin fenolinen hydroksyyliryhmä ja histidiinin imidatsoliryhmä osoittavat kaikki jonkin verran pH-riippuvaista ionisaatiota.
Siinä on neljä aminohappoa, joissa on varautuneet sivuketjut. Asparagiinihapolla ja glutamiinihapolla on karboksyyliryhmät sivuketjuissaan. Jokainen happo ionisoituu täysin pH: ssa 7,4. Arginiinilla ja lysiinillä on sivuketjut aminoryhmien kanssa. Niiden sivuketjut protonoidaan täysin pH: ssa 7,4.