siRNA, joka tarkoittaa pieniä häiritseviä ribonukleiinihappoja, on luokka kaksijuosteisia RNA-molekyylejä. Sitä kutsutaan joskus lyhyeksi häiritseväksi RNA: ksi tai vaimentavaksi RNA: ksi.
Pieni häiritsevä RNA (siRNA) on pieniä kaksijuosteisen (ds) RNA: n paloja, yleensä noin 21 nukleotidiä pitkä, 3 '(lausutaan kolme-aluinen) ulokkeella (kaksi) nukleotidit) molemmissa päissä, joita voidaan käyttää "häiritsemään" proteiinien translaatiota sitoutumalla Messenger RNA: n (mRNA) ja edistämällä sen hajoamista spesifisissä sekvenssit.
siRNA-toiminto
Ennen sukellusta mihin tarkalleen siRNA on (ei pidä sekoittaa miRNA), on tärkeää tietää RNA: ien toiminta. Ribonukleiinihappo (RNA) on kaikissa läsnä oleva nukleiinihappo elävät solut ja toimii sanansaattajana, joka kuljettaa ohjeita DNA: sta DNA: n synteesin hallitsemiseksi proteiineja.
Viruksissa RNA ja DNA voivat kuljettaa tietoa.
Näin toimiessaan siRNA: t estävät spesifisten proteiinien tuotannon vastaavan mRNA: n nukleotidisekvenssien perusteella. Prosessia kutsutaan RNA-häiriöksi (RNAi), ja sitä voidaan kutsua myös nimellä siRNA-vaimennus tai siRNA-kaatuminen.
Mistä he tulevat
siRNA: n katsotaan yleisesti olevan peräisin pidemmästä eksogeenisen kasvun juosteista tai peräisin organismin ulkopuolelta (RNA, jonka solu ottaa vastaan ja läpikäyttää lisäprosessin).
RNA tulee usein vektorit, kuten virukset tai transposonit (geeni, joka voi muuttaa paikkoja genomissa). Näiden on havaittu vaikuttavan viruksenvastaiseen puolustukseen, ylituotetun mRNA: n tai mRNA: n hajoamiseen, joiden translaatio on keskeytetty, tai estämällä genomisen DNA: n häiriöitä transposoneilla.
Jokaisessa siRNA-juosteessa on 5 '(viisi aluetta) fosfaattiryhmä ja 3' hydroksyyli (OH) -ryhmä. Ne tuotetaan dsRNA: sta tai hiusneulaketjuisesta RNA: sta, joka soluun saatuaan halkaistaan RNaasi III: n kaltaisella entsyymillä, nimeltään Dicer, käyttämällä RNaasia tai restriktioentsyymit.
SiRNA sisällytetään sitten moniosaiseen proteiinikompleksiin, jota kutsutaan RNAi: n indusoimaan äänenvaimennuskompleksiin (RISC). RISC "etsii" sopivan kohde-mRNA: n, jossa siRNA sitten rentoutuu ja uskotaan antisense juoste ohjaa mRNA: n komplementaarisen juosteen hajoamista käyttämällä endo- ja eksonukleaasin yhdistelmää entsyymejä.
Lääketieteelliset ja terapeuttiset käytöt
Kun nisäkässolu kohtaa kaksijuosteinen RNA, kuten siRNA, se voi erehtyä viruksen sivutuotteeksi ja käynnistää immuunivasteen. Lisäksi siRNA: n lisääminen voi aiheuttaa tahattoman kohdistamisen, jos myös muita ei-uhkaavia proteiineja voidaan hyökätä ja koputtaa.
Liian paljon siRNA: n lisääminen kehoon voi johtaa epäspesifisiin tapahtumiin synnynnäisen immuunivasteen vuoksi aktivoitumisesta, mutta koska kyky voittaa mikä tahansa mielenkiintoinen geeni, siRNA: issa on potentiaalia monille terapeuttinen käyttö.
Monia sairauksia voidaan mahdollisesti hoitaa estämällä geenien ilmentyminen muuttamalla kemiallisesti siRNA: ita niiden terapeuttisten ominaisuuksien parantamiseksi. Joitakin ominaisuuksia, joita voitaisiin parantaa, ovat:
- Tehostettu toiminta
- Lisääntynyt seerumin stabiilisuus ja vähemmän kohteita
- Vähentynyt immunologinen aktivaatio
Siksi synteettisen siRNA: n suunnittelusta terapeuttiseen käyttöön on tullut suosittu tavoite monissa biofarmaseuttisissa yrityksissä.
Yksityiskohtainen tietokanta kaikista tällaisista kemiallisista muunnoksista kuratoidaan manuaalisesti osoitteessa siRNAmod, manuaalisesti kuratoitu tietokanta kokeellisesti validoiduista kemiallisesti modifioiduista siRNA: ista.